Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms