Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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SIX1Q15475 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SIX1Q15475 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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SIX1Q15475 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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SIX1Q15475 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SIX1Q15475 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SIX1Q15475 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SIX1Q15475 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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