Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms