Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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PDE6HQ13956 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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PDE6HQ13956 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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PDE6HQ13956 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
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PDE6HQ13956 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
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PDE6HQ13956 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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PDE6HQ13956 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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PDE6HQ13956 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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PDE6HQ13956 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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PDE6HQ13956 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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