Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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APOFQ13790 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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APOFQ13790 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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APOFQ13790 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
APOFQ13790 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
APOFQ13790 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
APOFQ13790 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
APOFQ13790 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
APOFQ13790 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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APOFQ13790 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
APOFQ13790 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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APOFQ13790 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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APOFQ13790 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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APOFQ13790 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
APOFQ13790 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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