Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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