Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms