Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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CBX3Q13185 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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CBX3Q13185 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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CBX3Q13185 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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CBX3Q13185 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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