Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHD3Q12873 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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