Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms