Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms