Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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USP35Q9P2H5 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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USP35Q9P2H5 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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USP35Q9P2H5 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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USP35Q9P2H5 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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USP35Q9P2H5 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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