Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms