Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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SSX1Q16384 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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SSX1Q16384 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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SSX1Q16384 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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SSX1Q16384 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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SSX1Q16384 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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SSX1Q16384 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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SSX1Q16384 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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SSX1Q16384 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SSX1Q16384 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SSX1Q16384 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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