Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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