Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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