Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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