Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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