Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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IFT88Q13099 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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IFT88Q13099 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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IFT88Q13099 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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