Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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GRIK2Q13002 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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