Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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