Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms