Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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