Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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NDUFA9Q16795 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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NDUFA9Q16795 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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