Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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GRIK5Q16478 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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GRIK5Q16478 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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GRIK5Q16478 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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GRIK5Q16478 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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GRIK5Q16478 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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GRIK5Q16478 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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