Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDCD1Q15116 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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