Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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