Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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