Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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