Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD4Q12950 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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