Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
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