Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIDA1Q1XH10 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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