Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
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