Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms