Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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CALCOCO2Q13137 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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CALCOCO2Q13137 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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CALCOCO2Q13137 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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CALCOCO2Q13137 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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