Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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SH3BP1Q9Y3L3 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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SH3BP1Q9Y3L3 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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SH3BP1Q9Y3L3 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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SH3BP1Q9Y3L3 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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SH3BP1Q9Y3L3 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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SH3BP1Q9Y3L3 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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