Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms