Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms