Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SKIDA1Q1XH10 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SKIDA1Q1XH10 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SKIDA1Q1XH10 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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