Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK5Q16478 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.1 ms