Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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