Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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SCN9AQ15858 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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