Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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SEMA3AQ14563 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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