Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms