Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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SP140Q13342 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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SP140Q13342 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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SP140Q13342 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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SP140Q13342 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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SP140Q13342 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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SP140Q13342 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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SP140Q13342 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP140Q13342 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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