Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms