Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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