Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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