Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms