Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTXN3Q4LDR2 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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